日本是仅次于中国的牡丹大国。早在公元8世纪的唐朝，据传高僧法海把牡丹带入日本。牡丹一传入日本就受到人们的喜爱，与樱花、荷花并列为皇家花卉。牡丹观赏栽培也进入了一个新的发展时期，并最终培育出了许多适应日本风土和爱好的品种——日本牡丹。

      日本牡丹是一个具有鲜明特征的品种群，绝大多数品种都是单瓣或半重瓣，即使少数重瓣品种也具有外露的正常雄、雌蕊；此外它们还具有较鲜亮的色彩，优美的线条，花头直立，无叶里藏花观象，形成了与中国牡丹的明显区别。1983年版的《最新园艺大辞典》（日）记载了190个品种。另外还有15个寒牡丹品种，11个欧洲品种和13个中国品种。

日本的牡丹栽培，进入明治时代（1868）后。就逐渐作为一种生产性园艺发展起来。在大阪的池田，兵库的宝冢，新泻的信浓川和阿贺野川流域以及岛根的大根岛等地相继出现了牡丹花圃。

日本的牡丹出口苗，规格一致，加工处理，包装等程序比较规范，在国际市场上价格较高。出口量也大于中国。日本还比较注意丰富本国的牡丹品种，二十世纪九十年代还从中国菏泽引进了万株牡丹苗，在日本最大的生产基地岛根县建立了中国牡丹园。